剖腹产毕竟是重大的腹部手术，Small说，手术增加了产妇出血和感染的可能性，增加了产后各种并发症的可能性，以及需要超过6周的产后恢复时间。从长远来看，剖腹产还可能影响妇女的生育能力，导致异常妊娠，如宫外孕。
2003年发表的一份英国科学报告发现，剖腹产的创伤性使妇女容易发生羊水栓塞，即羊水进入血液，造成危及生命的产妇死亡，这是近年来产妇死亡的主要原因。
澳大利亚昆士兰州的一位产科医生泰德-韦弗说，大多数选择剖腹产的妇女可以安全地分娩，但她们需要更长的时间来恢复，而且与自然分娩的妇女相比，她们更有可能在产后抑郁症和缺乏母乳的情况下挣扎。
研究表明，到目前为止，没有证据表明剖腹产比自然分娩更安全。由于婴儿没有被推过产道，一些胎儿的肺部液体不能被排出，这很容易导致新生儿窒息和肺透明膜等并发症，因为婴儿出生后不能自主呼吸。最近在德国发表的一份科学报告也指出，剖腹产的婴儿更有可能在出生后的第一年遭受食物过敏和腹泻。