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嘉兴市妇幼保健院成立于1932年，其前身是私立三一医院。1952年被政府接管后，改名为嘉兴市妇产医院，后改为嘉兴县妇产医院和嘉兴市妇幼保健院。2004年，它成为第二家更名为 "嘉兴市三一医院 "的医院。
医院占地100公顷，总面积为142300平方米，拥有920张执业床位。是一所集医疗、保健、科研、教学为一体的三级甲等妇幼保健院，是温州医科大学附属嘉兴市妇女儿童医院和嘉兴市应用科技大学附属嘉兴市妇女儿童医院，是国家标准化住院医师培训机构。
医院已形成了 "强专科、全方位 "的医疗发展格局，学科优势突出，专业特色明显，在省内外享有较高声誉。医院拥有孕产妇保健和新生儿保健两个国家级专科，提供从孕前到怀孕、分娩、新生儿、儿童等全周期的妇幼保健服务。医院的产科是全省首家区域性专业中心，围产医学是省、市联合发展的学科，生殖医学中心是省生殖医学创新团队的单位。医院拥有妇产科市级重点医学学科2个，儿科、小儿外科市级重点医学学科2个，乳腺、生殖医学、胎儿医学市级重点医学学科3个，中西医结合、儿童康复市级重点中医学科1个，市级重点创新团队2个，重点实验室1个。
此外，医院还设有市级危重孕产妇救治中心、市级危重新生儿救治中心、市级生殖医学中心、市级产前诊断中心、市级出生缺陷防控中心、市级妇幼心理健康联合治疗中心。市妇科内分泌诊治中心、市新生儿筛查管理中心、市妇幼保健信息中心、市妇幼保健院妇产科质控中心。
医院着力打造妇幼保健品牌学科。充分发挥妇产科临床与医疗相结合的优势，开设全市首家 "LDRP病房"，引入 "集群 "管理模式，妇产科得到进一步加强。我们建立了三个亚专业。产科、胎儿科和普通产科。我们形成了先进的围产观念和助产技术，无痛分娩率已接近发达国家水平。该院拥有强大的产科重症监护团队，对高危分娩实施分级管理，对危重孕妇的救治能力较强。2001年成立的产前诊断中心进行广泛的产前筛查和诊断，该市的产前筛查工作在全省领先。儿科持续增长，门诊和急诊服务量在该地区名列前茅。它拥有本市最大的新生儿治疗中心，并与上海新华医院的新生儿科紧密合作。每年转诊的危重新生儿超过600人，抢救成功率达到96%。同时，建立了本市唯一的儿科外科重症监护室。妇科不断发展，建立了四个专业治疗中心，即妇科内分泌治疗中心、盆底疾病治疗中心、宫颈癌治疗中心和宫腔镜中心，对各种良恶性妇科肿瘤进行综合治疗，并与上海红房子医院合作建立了宫腔镜治疗合作中心，90%的妇科手术采用微创方式进行。生殖医学中心成立于2000年，是本市唯一获准开展辅助生殖技术的中心。它每年进行近1200个试管婴儿周期，记录的临床妊娠率为51%。
医院在发展综合专业学科方面做出了巨大努力。乳房科是本市第一家。
近年来，医院遵循 "健康第一、务实求精、勤奋合作、科技兴院 "的精神，以点带面，创新管理，强化内涵，重视人文，实现了高质量发展。"全国百家优秀爱婴医院"、"全国妇幼保健院中医药工作示范单位"、"全国妇幼安全优质服务示范单位""母婴友好医院 "等荣誉称号，在全国公立三级医院绩效考核中连续两次获得生育专科医院考核优秀等级A。
嘉兴市妇幼保健院生殖中心。
嘉兴市生殖中心成立于2000年，是嘉兴市唯一专门从事生殖内分泌和不孕不育治疗的专业机构。该中心占地面积近1000平方米，百层层流近500平方米，环境舒适、优美、布局合理。设有临床科室、男科、实验室、辅助生殖实验室和护理部。中心拥有精子分析仪、进口B超、CO2培养箱、微量注射器、胚胎操作箱和胚胎冷冻箱等先进仪器。该中心可提供妇科内分泌检查、各种妇科内分泌疾病的治疗、促排卵、卵泡监测、宫腔镜下输卵管灌洗及手术、宫腹腔镜联合手术。超声引导下的盆腔囊肿介入治疗、精液分析、抗精子抗体测定、睾丸穿刺、中西医结合诊治男性不育症、自体受精、体外受精和胚胎冷冻。该中心提供体外受精、胚胎移植、囊胚培养和胚胎冷冻解冻、单精子细胞胞浆内注射、胚胎减压等多种检查和治疗服务。它是目前嘉兴市最大和最全面的生育中心。